MICROBIAL GENOME ANALYSIS
让基因组分析, 更清晰地抵达结论
面向微生物研究的计算平台:从基因组比较、物种界定到系统发育推断。
TOOLS
工具中心
EZAA已上线
AAI GENOME COMPARISON
EzAAI
基于蛋白编码序列的全两两 AAI 分析,并生成 UPGMA 聚类树。
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ORTH已上线
ORTHOLOGOUS ANI
OrthoANIu
使用 OrthoANIu 与 USEARCH 对上传基因组进行全两两 ANI 计算。
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UBCG已上线
BACTERIAL PHYLOGENOMICS
UBCG
从细菌核心基因构建系统发育树,默认 FastTree,也可选择 RAxML。
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UBCG已上线
BACTERIAL PHYLOGENOMICS · V2
UBCG v2
采用 UBCG v2 核心基因流程,交付拼接比对、GSI 树及 FastTree 或 RAxML 树。
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VISUALIZATION
科研绘图
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WORKFLOWS
分析流程
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